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東京マラソン（とうきょうマラソン、Tokyo?Marathon）は、2007年に始まった東京で行われるマラソン大会。正式名称には末尾に開催年が付される（第1回大会では「東京マラソン2007」）。毎年2月か3月に開催される。
これまで東京都心部で行われていたマラソン大会には、エリートランナー向けのフルマラソンである東京国際マラソン（男子）・東京国際女子マラソンと市民ランナー・障害者向けの10kmロードレースである東京シティロードレースの2つがあったが、それらを一つにまとめた上で、ニューヨークシティマラソン・ロンドンマラソン・ボストンマラソンに匹敵するような市民参加型の大規模シティマラソンとして計画された。
約3万人（2008年2月15日の会見で石原は将来的に5万人にしたいと述べた。東京マラソン2010では参加定員が一部見直され、マラソンの定員が前回の東京マラソン2009より2,000人増えて32,000人に、一方で10kmの定員が2,000人減って3,000人となる。